pukiwiki-1.5.3_utf8ってプログラムをダウンロードしてソース見た所、そのファイルのpukiwiki.ini.phpの534行にある$line_break = 0;を$line_break = 1;に変更する事で対応できる。付属のREADME.txtの80行あたりにも、この旨が書かれている。毒コンシェと関係ない話ですいません。管理者に連絡できるなら対応してもらう手もあるかも。